某日，在大内发生了火灾的同时，在左大臣的东三条殿也遭到异形的袭击。迄今为止从未察觉到的妖气，不断释放出危险气息逼近的正是来自遥远的西方大陆的妖怪，他们为了给负伤的妖主——穷奇治疗，瞄上了拥有极其强大灵力的左大臣之女——彰子姬……而后打败了穷奇，救下了彰子的昌浩，在忍受着误以为昌浩不认真工作的先辈阴阳生——藤原敏次所带来的不快的同时，继续工作。不久，平时颇为照顾昌浩的藤原行成突然遭到恶灵袭击，身染重病，生命垂危。此后，京都内发生了一连串怨灵作乱事件。彷徨四窜的灵，突然兴起的百鬼夜行。这一切事件的发生，都是由不断袭击晴明的女术师——风音所操纵……用自己的生命换回红莲的昌浩，靠其去世的祖母——若菜的祈愿。奇迹般地得以重返人世。但是，作为复活的代价，他的见鬼之力就此丧失。在失去阴阳师重要的灵力的昌浩前，新的敌人出现了……在代替彰子入宫的中宫章子身边，有神秘的黑影悄悄接近。此时，晴明天命之时也开始临近……
