《电波少女第二季》又名《Mission-E》，是《电波少女》动画的。《电波少女第二季》故事设定在未来的日本，一颗渺小的陨石不为人知的坠落在安满泽村，各地出现名为“TYPE-E”的变异人类，他们都获得了发射电磁波的能力。第一季《CODE-E》讲述陨石坠落的20年后的故事，而第二季《Mission-E》则是讲述第一季5年后的故事。主角是名为君冢麻织的E能力者，上一季的主角海老原千波美是君冢麻织的搭档，她们都属于帮助“TYPE-E”能力者适应社会的“OZ”组织，与名为“foundation”的想隔离E能力者进行管理的组织战斗着。
