此时，剑心知道朱鹭果然是严达的妹妹，为防止悲剧再次发生，剑心下定决心阻止时雨的错误行为。时雨发动袭击，双方都死伤惨重，千钧一发之际救下贵宾的剑心被迫与时雨交手，交战中，时雨发现剑心就是杀死严达的刽子手拔刀斋，悲愤之余邀剑心决一死战。剑心为救时雨说服陆军统帅，独自一人前去解决事情，经过决斗，时雨败于剑心的剑下，终于明白了好友严达的心意。
本来是时雨能和朱鹭一起好好生活下去的结局,却被田母野打碎。原来，他才是一切的幕后操纵者。他下令枪杀在场的所有人，时雨为了保护朱鹭而中弹身亡，剑心虽将田母野打倒，出卖时雨的叛徒加治木，也被贯彻'恶即斩'的斋藤一所杀，可到头来还是以悲剧收场……
浪客剑心-维新志士的镇魂歌还是一部影响很大，广受关注的动画电影，彩虹乐队演唱的主题歌《虹》更是脍炙人口，还发售了单曲CD。于1991年2月成立的彩虹乐队，现在由HYDE、TETSU、KEN和YUKIHIRO四人组成，是日本著名的视觉系超级摇滚乐队，国内很多爱好者就是由此开始接触视觉系的。
